水利部南京水利水文自動化研究所（簡稱南水所）位于南京市城南風景秀麗的秦淮河畔，毗鄰江寧高新技術開發區。南水所創建于1940年，前身為中央水利實驗處南京水工儀器實驗室，是我國最早成立的水利水文科學研究機構，建國后更名為“南京水文儀器研究室”，1981年組建南水所，是我國唯一從事水利信息化和水利自動化技術研究的專業研究所。
創建73年來，雖歷經多次變遷，但始終堅持水利水文基礎技術研究，始終堅持為水利防災減災、為國家公共安全服務。目前全國水文標準化技術委員會水文儀器分技術委員會、國際水文標準組織TC113秘書處、水利部水文水資源監控工程技術研究中心依托并設在我所，水利部《水利信息化》雜志編輯部設在我所，水利部水文儀器及巖土工程儀器質量檢驗測試中心、國家技術監督局水文儀器及巖土工程儀器生產許可證審查部掛靠在我所。
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